Родился в Шропшире, в Англии, однако большую часть детства провёл на британских военных базах в Англии и Германии. Блэкторн пробился в актёры, снимаясь в рекламе в Англии. Прорывом для него стала реклама, в которой он сыграл парня, перед которым проносится вся его жизнь, когда за ним приходит Смерть, для компании Virgin Atlantic. Реклама стала крайне успешной, и за ней последовала радио реклама.

Первой успешной ролью на киноэкранах для Блэкторна стала роль капитана Эндрю Рассела в номинированном на «Оскар» индийском фильме Лагаан: Однажды в Индии. Он провёл шесть месяцев, изучая хинди для роли.

Он также снимался в Mindcrime, а также в фильме Four Corners of Suburbia, длинном инди фильме, победившем на Фестивале фильмов Перекрёсток в номинации Лучшая повествовательная лента (2006) и в категории Лучший композитор на Авиньонском фестивале фильмов в Авиньоне, во Франции (2006).

Пол снимался и в других независимых картинах — он сыграл Брета Истона в This is Not an Exit Эллиса, а также снимался в одной из главных ролей в британском фильме The Truth Game. Одной из последних ролей Пола стала роль «Джонаса Эксайлера» в инди фильме Special, вместе с Майклом Рапапортом. Снялся в главной роли фильма «Дейзи Уинтерс» (2017).

В 2002 году Блэкторн сыграл доктора Мэтта Слингерленда в сериале Presidio Med и появился в заметной роли Гая Мортон в британском сериале Holby City. Сыграл Лиама МакГрегора в Peak Practice, доктора Джереми Лоусона в Скорой помощи и биологического террориста Стивена Сандерса в сериале «24 часа». Он также появился в сериалах «Медиум» (в двух ролях, вторая не была указана в титрах), «Дедвуд» и «Детектив Монк».

В сериале «Помадные джунгли» он в течение двух сезонов играл Шейна Хили, музыканта и мужа Венди Хили (сыгранной Брук Шилдс), одной из главных героинь сериала. Блэкторн появился в сериале «Чёрная метка» в роли ирландского террориста на один эпизод в 2009 году. В 2010 году он появился в двух эпизодах сериала «Воздействие», как продавец оружия, и в одном эпизоде «C.S.I.: Место преступления Майами», срежиссированном Робом Зомби. Позже в том же году Блэкторн получил постоянную роль Кристиана Харпера в сериале «Врата». 7 декабря 2010 года он появился в рождественском эпизоде сериала «Хранилище 13». Также появился в межсезонном эпизоде сериала Белый воротничок.

В сериале 2007 года Файлы Дрездена, выпущенном каналом Sci Fi, Блэкторн сыграл главную роль, профессионального волшебника Гарри Дрездена.

Также Пол появился в роли Кларка Куайетли в сериале «Река» канала ABC, сюжет которого крутится вокруг группы людей, отправившихся на поиски исследователя природы, пропавшего в Амазонке.

Осенью 2012 года Пол Блэкторн присоединился к съёмочной команде сериала «Стрела» в качестве одного из главных персонажей, детектива Квентина Лэнса, отца сестер Сары и Лорелл Лэнс.

Пол Блэкторн также является выдающимся фотографом. Его выставка под названием Delhi to Manhattan проходила в Доме Тибета (англ. Tibet House) в Нью-Йорке с апреля по июнь 2009 года. Она проводилась ради тибетских детей, живущих в деревне Дармсала.

В 2001 году, вскоре после съёмок фильма Lagaan в Индии, город, в котором проходили съёмки, был повреждён землетрясением, затронувшем также и апартаменты съёмочной команды фильма. Чтобы помочь жертвам землетрясения, Блэкторн выставил свои фотографии на специальной благотворительной выставке в Лондоне.

Личная жизнь

На декабрь 2015 года известно, что встречается с Кейли Куоко. Так же является болельщиком Лондонского футбольного клуба «Арсенал».